Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms