Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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UBL4AP11441 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBL4AP11441 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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