Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FAM236CP0DP71 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms