Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C4BP0C0L5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4BP0C0L5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms