Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBP07199 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBP07199 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms