Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EDN1P05305 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EDN1P05305 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EDN1P05305 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EDN1P05305 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms