Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1AO95602 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms