Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SNAPINO95295 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms