Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBDO15205 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBDO15205 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBDO15205 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms