Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms