Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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