Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA3F8WFD2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms