Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms