Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSAPA4D1B5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms