Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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