Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPRKBQ9Y3C4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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