Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMED7Q9Y3B3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMED7Q9Y3B3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms