Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms