Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK2Q9UPX8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms