Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK1Q9UPV9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms