Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF24Q9UPV7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms