Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTF2Q9UNY4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms