Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCG2Q9UNQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms