Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms