Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms