Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTNAP2Q9UHC6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms