Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms