Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF7Q9UBF6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RNF7Q9UBF6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RNF7Q9UBF6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RNF7Q9UBF6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF7Q9UBF6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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