Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms