Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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