Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NKIRAS1Q9NYS0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms