Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLC39A9Q9NUM3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLC39A9Q9NUM3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLC39A9Q9NUM3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms