Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT84Q9NSB2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms