Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS4Q9NRS4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms