Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NRIP3Q9NQ35 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms