Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms