Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIFKQ9BYG3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms