Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5DQ9BY66 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms