Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms