Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-6Q9BXR3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-6Q9BXR3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms