Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTDSS2Q9BVG9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTDSS2Q9BVG9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms