Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD2Q9BTF0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms