Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms