Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHDQ96IW2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms