Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCARF2Q96GP6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms