Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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