Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNDC1Q96C34 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNDC1Q96C34 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms