Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35B4Q969S0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms