Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HLA-CQ95604 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-CQ95604 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms