Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXB13Q92826 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms